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PostePublic
FP d'État Cat. AEmploi ouvert uniquement aux contractuelsRecherche & InnovationIl y a 1 mois

Postdoctorant Projet Innovant – Bio-informatique H/F

Université Paris-Saclay (ouvre un nouvel onglet) — Université Paris-Saclay

Localisation
Yvelines (78), France (78)
Publication
31 juillet 2026
Domaine
Recherche
Secteur
Recherche & Innovation

Missions principales

Mission et positionnement de l’agent.e : Le projet global se déroule selon une progression structurée en plusieurs phases. Dans un premier temps, les 3 premiers mois seront consacrés à l’analyse des données de cytométrie spectrale déjà acquises. Cette phase permettra d’obtenir une première caractérisation phénotypique détaillée. Au cours de la période suivante, entre M3 et M6, le candidat réalisera les étapes de contrôle qualité et de prétraitement des données permettant les analyses des données séquençage sur cellule unique des ARN et du TCR ainsi que analyses fonctionnelles protéiques de manière indépendantes. Enfin dans le dernier temps entre M6 et M12, les comparaisons entre endotypes seront menées avec une intégration multi-omique permettant d’identifier des signatures discriminantes, suivie d’un travail de simplification en vue de la transposition clinique. Les principaux jalons du projet sont l’obtention d’un jeu de données complet en cytométrie, la disponibilité des données multi-omiques intégrées, l’identification de signatures biologiques robustes et la définition d’une signature candidate transposable en pratique.

Compétences attendues

Mission et positionnement de l’agent.e : Le projet global se déroule selon une progression structurée en plusieurs phases. Dans un premier temps, les 3 premiers mois seront consacrés à l’analyse des données de cytométrie spectrale déjà acquises. Cette phase permettra d’obtenir une première caractérisation phénotypique détaillée. Au cours de la période suivante, entre M3 et M6, le candidat réalisera les étapes de contrôle qualité et de prétraitement des données permettant les analyses des données séquençage sur cellule unique des ARN et du TCR ainsi que analyses fonctionnelles protéiques de manière indépendantes. Enfin dans le dernier temps entre M6 et M12, les comparaisons entre endotypes seront menées avec une intégration multi-omique permettant d’identifier des signatures discriminantes, suivie d’un travail de simplification en vue de la transposition clinique. Les principaux jalons du projet sont l’obtention d’un jeu de données complet en cytométrie, la disponibilité des données multi-omiques intégrées, l’identification de signatures biologiques robustes et la définition d’une signature candidate transposable en pratique.

Profil attendu

Connaissance, savoir : La personne recrutée devra maîtriser les outils d’analyse de séquençage et une bonne maîtrise des langages de programmation R et Python. Des compétences en statistiques avancées sont essentielles pour la modélisation des données et la prise en compte de la variabilité biologique. La capacité à gérer des jeux de données volumineux et complexes, ainsi qu’à produire des visualisations claires et interprétables, est également attendue. Une expérience dans des projets interdisciplinaires impliquant des interactions entre cliniciens et biologistes constituera un atout important. Savoir-faire : Maîtriser les outils d’analyse bioinformatique de séquençage et des langages de programmation R et Python Savoir-être : Courtois et respectueux

Métier de référence

Chercheuse / Chercheur

Comprendre ce poste

Ce postdoctorat s'inscrit dans un projet de recherche structuré visant à décrypter des phénotypes biologiques complexes à partir de données multi-omiques. Le chercheur pilote l'analyse de données de cytométrie spectrale, de séquençage unicellulaire et de protéomique fonctionnelle, avant d'en extraire des signatures discriminantes exploitables cliniquement. C'est un rôle clé dans la chaîne de valorisation recherche-clinique : transformer des données massives et hétérogènes en connaissances translationnelles.

Le recrutement dans ce cadre

Ce contrat relève de la catégorie A de la fonction publique d'État, offrant un positionnement académique solide. Réservé aux contractuels, il constitue une opportunité de consolidation de profil postdoctoral en milieu universitaire structuré. L'environnement Paris-Saclay favorise les collaborations interdisciplinaires et les débouchés vers des postes permanents ou des trajectoires de recherche à l'international.

Conseils pour candidater

  • **Mettre en avant l'expérience en traitement multi-omique et bioinformatique appliquée** : détailler des projets antérieurs où R et Python ont été utilisés sur des jeux complexes, avec résultats publiés ou présentés. Chiffrer : nombre d'échantillons analysés, pipelines développés.
  • **Démontrer la capacité à piloter une approche scientifique de bout en bout** : montrer comment candidat.e a conduit un projet de l'hypothèse à la validation, en traversant plusieurs étapes analytiques distinctes, plutôt que d'énumérer des compétences isolées.
  • **Valoriser l'expérience d'interface recherche-clinique** : mentionner des collaborations avec des cliniciens, des publications en traduction clinique, ou une compréhension des contraintes du passage du banc à la pratique.

Éclairage rédigé par PostePublic pour contextualiser cette offre.

Réf. 2026-2370327Fonction publique d'État

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