Ingénieur-e d’étude en biologie synthétique de la levure

Vous serez accueilli au sein de l'Institut Micalis, unité mixte de recherche associant l'INRAE et AgroParisTech et faisant partie de l'Université Paris-Saclay. Sa mission est de développer des recherches innovantes dans le domaine de la microbiologie des aliments pour la santé. Les trois axes thématiques correspondent à trois domaines de recherche prioritaires: -L'émergence et le contrôle des microorganismes pathogènes opportunistes d'origine alimentaire et l'adaptation des bactéries à leur environnement. -Les écosystèmes microbiens alimentaires et intestinaux et les interactions fonctionnelles entre l'aliment, le microbiote et l'hôte. -La biologie synthétique et la biologie des systèmes microbiens Le projet sera réalisé au sein de l’équipe de recherche "Cosynus" dirigée par Tristan Rossignol et Young-Kyoung Park à l'Institut Micalis, dans la division de Microbiologie des Systèmes et de Synthèse. L'équipe se concentre sur le développement de consortia synthétiques comme usines cellulaires microbiennes et possède une forte expertise dans la biologie synthétique de la levure Yarrowia lipolytica, espèce à fort potentiel en tant que châssis industriel 1. Les usines cellulaires microbiennes sont considérées comme une alternative prometteuse à la production pétrochimique ou à l'extraction de produits végétaux. Nous nous concentrons particulièrement sur la bioproduction de terpènes et de pigments 2. Les caroténoïdes sont des pigments présentant des propriétés antioxydantes, nutraceutiques d’intérêt industriel, mais leur extraction à partir de sources naturelles est souvent inefficace et coûteuse. Le projet vise à utiliser la levure Yarrowia lipolytica comme usine microbienne pour la biosynthèse de caroténoïdes, en introduisant et en optimisant des voies métaboliques spécifiques aux algues. Cette plateforme microbienne offre une alternative modulaire et plus écologique à la synthèse chimique ou à l'extraction de caroténoïdes spécifiques à partir de plantes ou d'algues, présents uniquement à faibles concentrations. Vous serez plus particulièrement en charge de : - l’ingénierie génétique de Y. lipolytica à l'aide d'outils de biologie synthétique (GoldenGate assembly, CRISPR, etc.) - l’analyse des croissances à différentes échelles (microplaques, erlen, etc.) - analyses des métabolites (substrats et caroténoïdes – HPLC)