Ingénieur·e d'étude en vision par ordinateur

L’Institut Sophia Agrobiotech (ISA) se positionne comme un pôle majeur de recherche en biocontrôle, s’appuyant sur des infrastructures expérimentales et numériques générant un volume croissant de données d’imagerie. Au sein de l’infrastructure scientifique collective PlantBIOs, ces données couvrent un large spectre d’échelles biologiques, depuis la microscopie cellulaire et subcellulaire jusqu’à l’imagerie de macro organismes, dans des contextes expérimentaux variés et complexes. L’analyse du mouvement, du comportement et des dynamiques biologiques constitue un axe structurant pour la compréhension des interactions entre plantes, ravageurs, micro-organismes et organismes bénéfiques. Les approches classiques d’analyse d’images atteignent aujourd’hui leurs limites face à la complexité des données produites (bruit, chevauchement d’objets, hétérogénéité des échantillons, pertes d’identité des individus, données 3D ou temporelles). Les méthodes d’intelligence artificielle, et en particulier d’apprentissage profond, représentent un levier essentiel pour lever ces verrous technologiques et méthodologiques. Sur le plateau de vidéophénotypage de l’ISC PlantBIOs, le recours à l’IA permettrait le suivi d’individus ou de groupes en environnements complexes, l’analyse du comportement, le maintien de l’identité au sein de populations et l’étude des interactions inter-individuelles, en 2D comme en 3D. Ces développements sont indispensables pour caractériser les macro-organismes d’intérêts en santé des plantes et exploiter pleinement le potentiel des dispositifs expérimentaux. Dans ce contexte, le projet IPIDEO (AAP 2025 du PEPR AgroEcologie et Numérique) vise notamment à développer des outils de vision par ordinateur pour l’étude des dynamiques comportementales des insectes et des interactions plantes-insectes. Ce projet regroupe un consortium de chercheurs issus de 13 unités de 5 établissements partenaires (INRAE, INRIA, CNRS, CEA, Université de Toulouse Capitole).