Ingénieur(e) de Recherche- Bio-informaticien(ne)

Vous rejoindrez une équipe de recherche dynamique impliquée dans un projet européen ambitieux visant à comprendre comment les caractéristiques moléculaires du moustique tigre, son microbiote et les conditions environnementales locales influencent sa capacité à transmettre les quatre sérotypes du virus de la dengue. Vous jouerez un rôle central dans l’analyse et l’intégration des données transcriptomiques et métagénomiques produites dans le cadre des différentes actions du projet TIGRUN. Ces données seront issues de plusieurs tissus du moustique, de différents temps post-infection, des quatre sérotypes du virus de la dengue et de populations naturelles provenant de plusieurs zones microclimatiques de La Réunion. Vos missions: Concevoir, développer, optimiser et documenter des pipelines bioinformatiques reproductibles pour l’analyse de données de séquençage à haut débit Assurer le contrôle qualité, le prétraitement, l’alignement, la quantification et l’analyse statistique des données transcriptomiques issues des différents tissus et conditions expérimentales Conduire les analyses d’expression différentielle et contribuer à l’identification de signatures moléculaires, de voies biologiques et de réseaux de gènes associés à l’infection par les différents sérotypes du virus de la dengue Analyser les données de métagénomique shotgun afin de caractériser la diversité taxonomique et fonctionnelle des microbiotes associés aux populations naturelles d’Aedes albopictus Réaliser des analyses comparatives permettant d’étudier les variations du microbiote entre les localités, les conditions environnementales et les modalités de collecte des moustiques Intégrer les données transcriptomiques et métagénomiques aux métadonnées expérimentales, environnementales et entomologiques, notamment les tissus étudiés, les sérotypes viraux, les temps post-infection, les microclimats et les niveaux de compétence vectorielle Contribuer à l’interprétation biologique des résultats en interaction étroite avec les différents membres et partenaires scientifiques du projet Assurer la structuration, la documentation, la traçabilité et la gestion des données produites, dans le respect des principes de reproductibilité et de science ouverte Développer et maintenir un site web interactif destiné à la consultation et à la visualisation des données transcriptomiques et métagénomiques du projet par la communauté scientifique Contribuer à la rédaction d’articles scientifiques, de rapports techniques et de documents de valorisation Présenter les résultats lors de réunions de consortium, de séminaires et de congrès scientifiques nationaux et internationaux Participer au transfert de compétences en bioinformatique et à l’accompagnement des étudiants et personnels impliqués dans le projet. Ce poste vous permettra d’évoluer dans un environnement scientifique multidisciplinaire et international.