Chercheur.euse en épidémiologie spatiale

En vous appuyant sur des projets financés en cours, des bases de données spatialisées disponibles et des collaborations établies avec les acteur.trice.s de la gestion des risques sanitaires, votre mission consistera à développer de nouvelles approches en épidémiologie spatiale afin d’améliorer la surveillance des maladies infectieuses animales. Ces travaux viseront en particulier à renforcer la capacité des dispositifs de surveillance à détecter précocement de nouvelles émergences, et à identifier les populations au sein desquelles la surveillance doit être priorisée, notamment lors d’épidémies. Ce poste aura également vocation à vous permettre d’affirmer votre capacité à définir, construire et porter une ligne de recherche propre en épidémiologie spatiale. Vous serez en charge de : - développer des cadres méthodologiques innovants permettant, d’une part, d’intégrer les dimensions spatiales et les réseaux de contacts et, d’autre part, de combiner des sources de données hétérogènes au sein de modèles représentant explicitement les processus épidémiologiques et d’observation. Pour cela, vous mobiliserez des méthodes d’inférence bayésienne ainsi que des développements récents en intelligence artificielle ; - développer des pipelines d’analyse reproductibles et régulièrement actualisables, permettant l’intégration de nouvelles données et la production d’indicateurs spatiaux en temps quasi réel, afin d’appuyer la priorisation de la surveillance ; - appliquer et évaluer ces approches sur plusieurs cas d’étude, qui pourront notamment porter sur la surveillance syndromique fondée sur les données de mortalité en élevage et dans la faune sauvage, la surveillance de l’influenza aviaire hautement pathogène chez les oiseaux sauvages et l’étude de la transmission de la tuberculose bovine en France. D’autres pathosystèmes pourront être mobilisés en fonction des opportunités scientifiques et des besoins des partenaires porteurs d’enjeux liés à la surveillance sanitaire ; - construire et porter un programme de recherche en épidémiologie spatiale, en développant des collaborations au sein de l’Unité et avec ses partenaires nationaux et internationaux, en valorisant les résultats par des publications scientifiques, des logiciels et des méthodes réutilisables, et en contribuant au montage de nouveaux projets et à la recherche de financements. L’objectif étant de consolider durablement cet axe méthodologique au sein du collectif de recherche. Ces activités seront conduites en collaboration étroite avec des épidémiologistes, modélisateur.trice.s, écologues, informaticien.ne.s et acteur.trice.s des dispositifs de surveillance en santé animale. Vous bénéficierez d’une autonomie scientifique importante pour définir vos orientations méthodologiques, développer un programme de recherche et établir de nouvelles collaborations, en cohérence avec les priorités scientifiques de l’unité.